โรงพยาบาลศรีธัญญา เดิมชื่อว่า โรงพยาบาลโรคจิตนนทบุรี ด้วยความริเริ่มดำเนินการของ นายแพทย์หลวงวิเชียรแพทยาคม ตั้งอยู่เลขที่ 47 ถนนติวานนท์ หลักกิโลเมตรที่ 1 หมู่ที่ 4 ตำบลตลาดขวัญ อำเภอเมือง จังหวัดนนทบุรี สังกัดกรมสาธารณสุข กระทรวงมหาดไทย มีพื้นที่จำนวน 1,067 ไร่ เปิดดำเนินการเมื่อวันที่ 24 มิถุนายน พ.ศ.2484 โดยมีนายแพทย์ขจร อ้นตระการ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการคนแรก เมื่อเริ่มเปิดดำเนินการได้รับโอนผู้ป่วยชายเรื้อรัง จำนวน 150 คน จากโรงพยาบาลโรคจิตธนบุรี หรือ สถาบันจิตเวชศาสตร์สมเด็จเจ้าพระยา ในปัจจุบัน ต่อมาเมื่อวันที่ 10 มีนาคม พ.ศ.2485 โรงพยาบาลโรคจิตนนทบุรี ได้ย้ายมาสังกัดโรงพยาบาลโรคจิต กรมการแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข

ปัจจุบันโรงพยาบาลศรีธัญญา สังกัดกรมสุขภาพจิต กระทรวงสาธารณสุข เป็นโรงพยาบาลเฉพาะทาง บำบัดรักษาผู้ป่วยโรคทางจิตเวช ขนาด 1,430 เตียง มีพื้นที่ทั้งหมด 415 ไร่ 57 ตารางวา ได้รับการพัฒนาด้านการให้บริการ และสิ่งแวดล้อม สถานที่มีความสวยงาม มีผู้ศึกษาดูงานมากมาย ทั้งในและต่างประเทศ